В статье рассматривается состояние научно-технологического взаимодействия Украины и России, дается оценка его потенциала в условиях перехода к инновационной экономике, приводятся области перспективного сотрудничества двух стран и механизмы их сотрудничества на основе развития кластерного механизма.