В статье рассматриваются предпосылки и основные направления реформирования российской науки, объективные и субъективные причины ее реорганизации. Для реформирования российской науки в рамках объективных причин представлены основные направления преобразования научного комплекса с учетом исторически сформировавшихся традиций, особенностей науки как сферы деятельности и перспективных национальных интересов страны. Отмечается, что важными условиями являются активное участие самих ученых в реформировании и наличие альтернативных для научных коллективов путей реорганизации в рамках новой национальной модели науки.